Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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