Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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ChmQ9QXG2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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ChmQ9QXG2 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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