Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

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Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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