Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms