Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL0

Crim1, Cysteine-rich motor neuron 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crim1Q9JLL0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Trdv4-201ENSMUST00000103679 444 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Gm15568-201ENSMUST00000118589 1213 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Gm26626-201ENSMUST00000180989 713 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Snhg14-204ENSMUST00000185890 756 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Scgb2b1-201ENSMUST00000189372 338 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Gm37741-201ENSMUST00000191768 1256 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Gm31306-201ENSMUST00000197517 508 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Vmn1r-ps5-201ENSMUST00000202963 931 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Gm44688-201ENSMUST00000209083 537 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Gm19137-201ENSMUST00000213790 1164 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Vmn1r41-204ENSMUST00000227039 985 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Vmn1r41-205ENSMUST00000227630 827 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Gm26203-201ENSMUST00000082911 114 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Olfr1224-ps1-201ENSMUST00000099792 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Vsnl1-202ENSMUST00000220506 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 1700017N19Rik-206ENSMUST00000190386 1483 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Pfn4-201ENSMUST00000020967 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Gm11480-201ENSMUST00000120214 659 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Tex35-204ENSMUST00000121911 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Gm14902-201ENSMUST00000145576 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Gm16588-201ENSMUST00000162889 355 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Gm38320-201ENSMUST00000192767 1281 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Gm43556-201ENSMUST00000196186 681 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Gm42948-201ENSMUST00000199085 578 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Crim1Q9JLL0 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms