Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms