Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms