Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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