Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 59 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smco4Q9JIS3 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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