Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
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