Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube3bQ9ES34 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube3bQ9ES34 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube3bQ9ES34 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube3bQ9ES34 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube3bQ9ES34 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube3bQ9ES34 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube3bQ9ES34 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube3bQ9ES34 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube3bQ9ES34 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube3bQ9ES34 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube3bQ9ES34 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube3bQ9ES34 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube3bQ9ES34 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube3bQ9ES34 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube3bQ9ES34 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube3bQ9ES34 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube3bQ9ES34 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube3bQ9ES34 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube3bQ9ES34 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube3bQ9ES34 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube3bQ9ES34 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube3bQ9ES34 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube3bQ9ES34 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube3bQ9ES34 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube3bQ9ES34 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube3bQ9ES34 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube3bQ9ES34 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube3bQ9ES34 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube3bQ9ES34 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube3bQ9ES34 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube3bQ9ES34 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube3bQ9ES34 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube3bQ9ES34 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube3bQ9ES34 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube3bQ9ES34 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube3bQ9ES34 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube3bQ9ES34 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube3bQ9ES34 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube3bQ9ES34 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube3bQ9ES34 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube3bQ9ES34 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms