Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms