Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
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Cldn34b2Q9D9N2 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Cldn34b2Q9D9N2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Cldn34b2Q9D9N2 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
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Cldn34b2Q9D9N2 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Cldn34b2Q9D9N2 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Cldn34b2Q9D9N2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Cldn34b2Q9D9N2 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34b2Q9D9N2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Cldn34b2Q9D9N2 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Cldn34b2Q9D9N2 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Cldn34b2Q9D9N2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34b2Q9D9N2 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34b2Q9D9N2 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34b2Q9D9N2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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