Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms