Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms