Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms