Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot8Q9D8X5 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot8Q9D8X5 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot8Q9D8X5 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot8Q9D8X5 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot8Q9D8X5 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot8Q9D8X5 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot8Q9D8X5 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot8Q9D8X5 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot8Q9D8X5 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot8Q9D8X5 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot8Q9D8X5 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot8Q9D8X5 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot8Q9D8X5 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot8Q9D8X5 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot8Q9D8X5 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot8Q9D8X5 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot8Q9D8X5 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot8Q9D8X5 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot8Q9D8X5 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot8Q9D8X5 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot8Q9D8X5 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot8Q9D8X5 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot8Q9D8X5 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot8Q9D8X5 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot8Q9D8X5 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot8Q9D8X5 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot8Q9D8X5 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot8Q9D8X5 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot8Q9D8X5 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot8Q9D8X5 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot8Q9D8X5 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot8Q9D8X5 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot8Q9D8X5 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot8Q9D8X5 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot8Q9D8X5 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot8Q9D8X5 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot8Q9D8X5 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot8Q9D8X5 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot8Q9D8X5 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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