Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Snx5Q9D8U8 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Snx5Q9D8U8 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Snx5Q9D8U8 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Snx5Q9D8U8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Snx5Q9D8U8 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Snx5Q9D8U8 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Snx5Q9D8U8 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Snx5Q9D8U8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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