Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rexo2Q9D8S4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rexo2Q9D8S4 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rexo2Q9D8S4 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rexo2Q9D8S4 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rexo2Q9D8S4 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rexo2Q9D8S4 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rexo2Q9D8S4 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rexo2Q9D8S4 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rexo2Q9D8S4 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rexo2Q9D8S4 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms