Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh4Q9D8F1 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms