Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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