Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Capns2Q9D7J7 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Capns2Q9D7J7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Capns2Q9D7J7 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Capns2Q9D7J7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Capns2Q9D7J7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Capns2Q9D7J7 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Capns2Q9D7J7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Capns2Q9D7J7 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Capns2Q9D7J7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Capns2Q9D7J7 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Capns2Q9D7J7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Capns2Q9D7J7 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Capns2Q9D7J7 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Capns2Q9D7J7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Capns2Q9D7J7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Capns2Q9D7J7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Capns2Q9D7J7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Capns2Q9D7J7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Capns2Q9D7J7 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Capns2Q9D7J7 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Capns2Q9D7J7 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Capns2Q9D7J7 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Capns2Q9D7J7 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Capns2Q9D7J7 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Capns2Q9D7J7 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Capns2Q9D7J7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Capns2Q9D7J7 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Capns2Q9D7J7 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Capns2Q9D7J7 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Capns2Q9D7J7 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Capns2Q9D7J7 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Capns2Q9D7J7 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Capns2Q9D7J7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Capns2Q9D7J7 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Capns2Q9D7J7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Capns2Q9D7J7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Capns2Q9D7J7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Capns2Q9D7J7 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Capns2Q9D7J7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Capns2Q9D7J7 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Capns2Q9D7J7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Capns2Q9D7J7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Capns2Q9D7J7 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Capns2Q9D7J7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Capns2Q9D7J7 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms