Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms