Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Pfn4Q9D6I3 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pfn4Q9D6I3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms