Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms