Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcc1Q9D4H2 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gcc1Q9D4H2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms