Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms