Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt44Q9D2Q2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Trmt44Q9D2Q2 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Trmt44Q9D2Q2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Trmt44Q9D2Q2 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Trmt44Q9D2Q2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Trmt44Q9D2Q2 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Trmt44Q9D2Q2 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Trmt44Q9D2Q2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Trmt44Q9D2Q2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Trmt44Q9D2Q2 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Trmt44Q9D2Q2 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Trmt44Q9D2Q2 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Trmt44Q9D2Q2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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