Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms