Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms