Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms