Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ssbp2Q9CYZ8 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ssbp2Q9CYZ8 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ssbp2Q9CYZ8 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ssbp2Q9CYZ8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ssbp2Q9CYZ8 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ssbp2Q9CYZ8 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ssbp2Q9CYZ8 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ssbp2Q9CYZ8 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ssbp2Q9CYZ8 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp2Q9CYZ8 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp2Q9CYZ8 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp2Q9CYZ8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp2Q9CYZ8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp2Q9CYZ8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp2Q9CYZ8 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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