Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrs1Q9CYH6 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rrs1Q9CYH6 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rrs1Q9CYH6 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rrs1Q9CYH6 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrs1Q9CYH6 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrs1Q9CYH6 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrs1Q9CYH6 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrs1Q9CYH6 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrs1Q9CYH6 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrs1Q9CYH6 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrs1Q9CYH6 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrs1Q9CYH6 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrs1Q9CYH6 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrs1Q9CYH6 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms