Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms