Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms