Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd12Q9CWU0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd12Q9CWU0 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd12Q9CWU0 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd12Q9CWU0 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd12Q9CWU0 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd12Q9CWU0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd12Q9CWU0 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd12Q9CWU0 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd12Q9CWU0 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd12Q9CWU0 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd12Q9CWU0 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tdrd12Q9CWU0 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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Tdrd12Q9CWU0 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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Tdrd12Q9CWU0 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tdrd12Q9CWU0 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Tdrd12Q9CWU0 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Tdrd12Q9CWU0 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
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Tdrd12Q9CWU0 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
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Tdrd12Q9CWU0 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Tdrd12Q9CWU0 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Tdrd12Q9CWU0 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Tdrd12Q9CWU0 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Tdrd12Q9CWU0 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Tdrd12Q9CWU0 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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