Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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