Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms