Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccer1Q9CQL2 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms