Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Rnaseh2cQ9CQ18 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Rnaseh2cQ9CQ18 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Rnaseh2cQ9CQ18 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Rnaseh2cQ9CQ18 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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