Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Smim3Q99PE5 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Smim3Q99PE5 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Smim3Q99PE5 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Smim3Q99PE5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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