Protein–RNA interactions for Protein: Q99M73

Krt84, Keratin, type II cuticular Hb4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt84Q99M73 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt84Q99M73 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms