Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms