Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms