Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

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Length 253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pagr1aQ99L02 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.1 ms