Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pacsin3Q99JB8 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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