Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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