Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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