Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sf3b5Q923D4 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms