Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms